進口雞蛋食安爭議延燒，農業部長陳吉仲於9月17日向政院提出辭呈，政院要求陳部長要對進口雞蛋議題說明清楚，並予以慰留。9月19日，陳部長再度召開記者會，直球對決外界抹黑與造謠，重申雞蛋進口政策是穩定民生，保障消費者，無須調降關稅，保護國內蛋農收益，回應了政院清楚說明議題的要求。記者會最後，陳吉仲貼出「農為國本」的照片，再次宣布請辭，並表達不接受慰留的堅定，也在臉書貼出2000千字長文抒發心情，回顧過往政績。
從陳部長在立院受訪及臉書上的說法，他辭職的理由，不外乎因抹黑、造謠，不實攻擊造成農業部同仁壓力及社會紛擾，要一肩扛責，讓紛擾平息。
然而，陳部長的請辭，國民黨台北市議員柳采葳照罵，陳吉仲「錢該賺的都賺飽了，可以拍拍屁股走人了。」「陳吉仲的請辭，卻完全體現民進黨對人民的不負責任，就像「渣男」一樣，犯後不理。」；台東縣長饒慶鈴在臉書發文「怎麼可以說走就走，誰來把事情說清楚，荒誕至極」；檳榔渣黨立委陳琬惠認為「陳吉仲若認為政策正確就要說明白，請辭前也必須解決爭議才是負責的態度，民進黨政府不能用政務官辭職的方式，來逃避監督。」；國民黨前台北市議員羅智強痛批「就算陳吉仲已經出面道歉，但這些過期的雞蛋都已經進到人民的肚子裡。」「這件事情的本質就是「謀財害命」，「謀財」就是超思50萬資本，狠賺3800萬的服務費。「害命」就是過期雞蛋進到人體、進到小孩子的肚子裡，危害大家健康」云云，可見陳部長的請辭，無異是親痛仇快，親痛的讓我錐心刺痛，不捨陳部長做到流汗，被人嫌倒流涎；仇快的讓國民黨跟民眾黨暗爽在心內，得了便宜還賣乖，他們只問利益不問是非，為反對而反對，搞下一位部長，嘴還是吐不出象牙，因為，社會紛擾不是陳部長造成的，社會紛擾不會因陳部長辭職而平息。
所謂承擔責任，是有做錯事，才要承擔，才有責任發生。例如，打傷他人，要負擔可能坐牢的刑事責任；要負擔賠償被害人的民事責任，要負擔社會秩序維護法的行政責任。陳部長是政務官，要承擔政治責任，承擔責任的效果，固然是下台，但是，他有做錯事嗎？他在立院受訪表示，進口雞蛋政策是正確的，效應是高於成本的，表示他沒做錯事；他辭職的理由是，因外界的抹黑、造謠，造成同仁壓力社會紛擾等等，既然是抹黑、造謠，就表示別人說的都是錯的，他就是要闢謠，把黑的還原成白的，他沒做錯事，也把事情說清楚了，就應該堂堂正正，以千萬人吾往矣的氣魄在他的職位上，繼續做到他在臉書上寫的：「為農業，我一生懸命。」，如果率爾辭職，不僅是拿別人的錯誤來懲罰自己，更是矮化自己原來作對事的合理性，反而強化抹黑、造謠的妥適性，社會紛擾依舊，所以，不管是行政院長或陳部長，我要不客氣的問，為了抹黑、造謠造成社會紛擾的始作俑者而辭職，辭職的正當性在哪？辭職真的是承擔嗎？